L'humour: tentative de définition et La théorie des mondes possibles: un outil pour l'analyse littéraire? en 2005-2006 ; De la figure à la fiction en 2006-2007 ; Sortir du temps: la littérature au risque du hors-temps, la même année ; Proust dans la recherche comparatiste, bilan et nouvelles perspectives, trois journées organisées en 2007-2008 (Proust et l'incertitude, Visages étrangers de Proust, Proust et les mondes lointains) ; Modernités antiques. La littérature occidentale (1910-1950) et les mythes gréco-romains, en 2007-2009 ; Lire contre l'auteur en 2009... L'Atelier de Fabula est depuis plusieurs années le partenaire de différents séminaires soulevant des questions de théorie littéraire et/ou s'inscrivant dans le champ des études de littérature générale et comparée. Depuis 2011, les actes du séminaire Anachronies - Textes anciens et théories modernes paraissent progressivement dans l'Atelier.